מיקומו של הגן הטכנולוגי במלחה מאפשר נסיעה מהירה ורגועה לעבודה וממנה – בכיוון המנוגד לעומס התנועה, הן בשעות הבוקר הן בשעות אחר הצהריים. בשטח הגן הטכנולוגי קיימים שטחי חניה נרחבים, מקורים ופתוחים, עבור העובדים ואורחיהם.

עורקי תחבורה מרכזיים מקשרים בין הגן לחלקיה השונים של העיר וליציאות ממנה. כביש מספר 443 (חוצה ירושלים) מקצר את זמן הנסיעה בין הגן הטכנולוגי ונתב"ג ל-40 דקות לכל היותר.

הרכבת הקלה של ירושלים תעבור בסמוך לשטח הגן וגם תחנת הרכבת בקו תל אביב ירושלים אשר נבנתה בסמוך לגן הטכנולוגי מאפשרת גישה מהירה ונוחה למתחם היישר ממרכז תל אביב.